Originariamente conosciuta con il nome di Kilnflat, la distilleria fu ribattezzata nel 1871 da Charles Kay. In seguito fu acquistata da Hiram Walker, che la utilizzava quasi interamente per la produzione del blended whisky Ballantine’s. La grande maggioranza dei single malt di Glenburgie sono perciò disponibili solo da imbottigliatori indipendenti.