Originalement connue sous le nom de Kilnflat, la distillerie est rebaptisée en 1871 par Charles Kay. Elle est ensuite rachetée par Hiram Walker qui l'utilise en quasi-totalité comme composante du blended whisky Ballantine's. La grande majorité des single malt de Glenburgie ne sont donc disponibles qu'en tant qu'embouteillage de négoce.

Glenburgie 15 ans sorti en 2017, en même temps qu'un Glentauchers et un Miltonduff du même âge. Ces éditions donnent à voir et à goûter les malts composant le célèbre blend Ballantine's qui donne son nom à la gamme.