Craigellachie est construit en 1890 par Charles Doig pour le compte de Sir Peter Mackie (White Horse) et d'Alexander Edward dont l'idée de faire un whisky plus délicat et fruité que ce qui se faisait à l'époque. Ce dernier est également à l'origine d'Aultmore, Dallas Dhu et Benromach. Il se retire de l'affaire en 1900 et revend ses parts à Mackie qui utilise Craigellachie pour ses assemblages : White Horse, Old Smuggler et Old Gaelic. Propriété de Distilers Company Limited (futur Diageo) qui rachète White Horse Distillers en 1927, Craigellachie est vendue au groupe Bacardi en 1998 en même temps qu'Aberfeldy, Aultmore et Royal Brackla. Longtemps dans l'ombre des assemblages où son style à la fois fruité, cireux et viandé est tant apprécié, le whisky de Craigellachie fait ses débuts en tant que single malt dans les années 1990 avec des apparitions dans les gammes Flora and Fauna et Rare Malt. Il a aujourd'hui sa propre ligne de single malt, lancée en 2014 parmi les Last Great Malts de Dewar's.

Craigellachie distillé en 1996 et embouteillé en 2012 après un affinage en fût de sherry par Le Clan des Grands Malts, un club français fondé en 1997 par des amateurs de whisky. Les adhérents bénéficient d'embouteillages exclusifs et ont la possibilité de participer à des dégustations et à des voyages.